le 19 juillet 2022 à 14h, à l’UFR Pharmacie, en amphi D
Florence Hammer-Dedet soutiendra publiquement sa thèse,
préparée au sein de l’Ecole Doctorale GAIA, filière Biologie des Interactions,
dirigée par Pr Estelle Jumas-Bilak et Dr Patricia Licznar-fajardo,
le 19 juillet à 14h, à l’UFR Pharmacie, en amphi D
Composition du jury :
Pr Corinne ARPIN, PU, Université de Bordeaux Rapporteur
Pr Didier HOCQUET, PU-PH, Université de Franche-Comté Rapporteur
Dr Hervé CAPIAUX, MCU, Université de Nantes Examinateur
Pr Estelle JUMAS-BILAK, PU-PH, Université de Montpellier Co-directrice
Dr Patricia LICZNAR-FAJARDO, MCU, Université de Montpellier Co-directrice
Résumé :
L’émergence et la rapide dissémination de Bactéries Productrices de Carbapénèmases (BPC) rend l’utilisation en médecine des carbapénèmes impossible et place dans des situations d’impasses thérapeutiques. La dissémination des gènes codant des carbapénèmases (GCC) au sein des bactéries est favorisée par leur présence sur des éléments génétiques mobiles notamment des plasmides. Longtemps délaissé, l’environnement et en particulier l’environnement hydrique, est dorénavant considéré comme un acteur à part entière dans le cycle de l’antibiorésistance, même si son rôle reste à préciser. Ainsi, l’isolement de BPC dans des eaux urbaines suggère que les milieux hydriques urbains pourrait constituer un réservoir pour les GCC, favorisant ainsi leur persistance et leur dissémination dans l’environnement et chez l’Homme. Afin d’étudier la résistance aux carbapénèmes en milieux hydriques urbains, deux principales approches ont été mises en œuvre. Une première à l’échelle de deux territoires urbains soumis à des pressions anthropiques différentes soit trois agglomérations de Côte d’Ivoire et une rivière de la ville de Montpellier, France. La présence et la quantité des GCC semblent fortement corrélées au niveau d’anthropisation des milieux hydriques considérés. L’environnement hydrique constituerait a minima un « relai » pour les BPC d’origine humaine. Par conséquent, l’étude de la résistance aux antibiotiques dans des eaux urbaines souillées par l’Homme est un outil de surveillance épidémiologique intéressant à développer. Dans la seconde approche, les capacités de dissémination et de persistance de GCC portés par des isolats bactériens issus d’eaux urbaines ont été étudiées. Il s’agit de deux Escherichia coli porteurs d’un plasmide IncX-3 encodant le gène blaNDM-5 et de deux Aeromonas hydrophila porteurs de plasmides IncP-6 et producteurs de KPC-2. Les plasmides IncX-3 ont certainement contribué à la dissémination du gène blaNDM-5 au sein des Enterobacterales, les bactéries du genre Aeromonas pourraient constituer des hôtes transitoires pour les plasmides IncP-6 et jouer un rôle important dans la dissémination du gène blaKPC-2. Cette étude de l’émergence, de la dissémination et de la persistance des GCC et des BPC en milieu hydrique urbain contribue à la description des cycles épidémiologiques de la résistance aux antibiotiques et est une approche à développer dans le contexte du plan de lutte global « One Health » contre l’antibiorésistance.
Mots clés :
carbapénémase, Aeromonas, Enterobacterales, plasmide, IncX-3, IncP-6, environnement hydrique, One Health
