Responsable technique : Angélique DESOEUVRE (IE, CNRS)
Référentes Scientifiques : Odile BRUNEEL (CR, IRD) et Marina HERY (MCF, UM)
Ce laboratoire est dédié à l’étude de la diversité et des fonctions des communautés microbiennes de l’environnement. Les activités du laboratoire, à l’interface entre écologie microbienne et géochimie ont pour objectifs:
1. d’élucider les processus biogéochimiques qui contrôlent le transfert des métaux et métalloïdes dans l’environnement,
2. d’étudier la dynamique des communautés microbiennes impliquées dans les processus de biotransformations et les facteurs environnementaux qui contrôlent leur activité.
L’isolement et la mise en culture de microorganismes permettent de caractériser leurs mécanismes d’interaction avec les éléments métalliques et d’évaluer leur influence sur le devenir de ces contaminants dans l’environnement.
Des approches de génomique environnementale (métabarcoding, et métagénomique et métatranscriptomique réalisés en partenariat ainsi que l’hybridation in situ, etc.) permettent d’appréhender la diversité microbienne et de comprendre la régulation des activités microbiennes in situ ou dans des systèmes de bioremédiation.
Le laboratoire de microbiologie environnementale est composé d’une pièce réservée aux approches culturales et d’une pièce réservée aux approches moléculaires.
EQUIPEMENTS :
Matériel destiné aux approches culturales :
- Centrifugeuse
- Centrifugeuse réfrigérée
- Bain-Marie
- Thermocycleur
- Hotte UV pour PCR
- Sorbonne
- Matériel électrophorèse
- Lampe UV
- Bioanalyseur
- SpeedVac
- Frigo américain
- Congélateur -80°C
Matériel destiné aux approches moléculaires :
- Hotte à flux laminaire horizontal
- Spectrophotomètre
- Balances
- Bain-Marie
- pH-mètre
- Autoclaves
- Incubateurs
- Agitateur thermostaté
- Frigo américain
- Armoire réfrigérante
- Congélateur -80°C
