Responsables : Elena Gomez
Frédérique Courant
Le plateau PONTEM fait partie des quatre plateaux de la plateforme MAMMA (Montpellier Alliance for Metabolomics and Metabolite Analysis) offrant un accès à des technologies analytiques de pointe pour l’étude du métabolisme. Le plateau PONTEM vous accompagne dans l’intégralité de la mise en œuvre de l’approche métabolomique (du design d’expérience à l’interprétation des données). Nos thématiques se situent principalement dans l’étude des organismes du milieu aquatique et de leur réponse aux pressions anthropiques. Nous pouvons toutefois facilement adapter notre approche à d’autres questions de recherche qui nécessite l’utilisation de la métabolomique.
Préparation des échantillons et mesure
- L’interprétation des données issues d’une analyse métabolomique non ciblée dépend de la qualité et de la quantité des données générées. Nous sommes à votre disposition pour discuter en amont du design d’expérience (nombre d’échantillons, collecte, conservation, …) à mettre en œuvre pour répondre au mieux à vos questions de recherche.
- Les matrices biologiques collectées peuvent être des tissus ou des fluides biologiques. La préparation des échantillons est la moins spécifique possible afin de se donner les chances de voir le maximum de métabolites sans a priori. Elle est toutefois orientée vers la mesures de composés polaires à semi-polaires.
- La prise d’empreinte est réalisée par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse haute résolution (LC-q-Exactive). Des expériences additionnelles en MS/MS peuvent être envisagées pour une confirmation de l’identité des marqueurs.
Mise à disposition des équipements
- LC-Orbitrap
